Оптимизмът на вирусолога Силвестри (в точки): какво знаем за Omicron и какво да правим

Оптимизмът на вирусолога Силвестри (в точки): какво знаем за Omicron и какво да правим
Оптимизмът на вирусолога Силвестри (в точки): какво знаем за Omicron и какво да правим
Anonim

«Докато „вирусолозите“с нулева титла в Twitter се състезават кой ще изстреля най-много, аз се опитвам да сложа някакъв ред в бурните открития от последните дни за Omicron, опитвайки се да бъда точен, ясен и разбираем.“

Така започва последната публикация, написана на страницата му във Facebook отГуидо Силвестри, световноизвестният патолог, който ни направи компания по време на първата вълна на Covid-19, превръщайки се в информационна отправни точки през 2020 г., също благодарение на списъка с причини, поради които трябваше да бъдем оптимисти по отношение на вируса.

Сега експертът, редовен професор и ръководител на катедрата по патология в университета Емори в Атланта, се върна към говоренето в социалните мрежи (в действителност той никога не е спирал), като публикува дълга реч, в която се опитва да вложи всичко по ред. се казва за новия вариант Omicron.

Ето всичко, което трябва да знаете (и да направите) според вирусолога.Какво знаем за Omicron

1. Omicron е много различен от Delta и други варианти на SARS-CoV-2, с 45 аминокиселинни мутации в сравнение с щама Wuhan, включително 30 в Spike протеина и цели 15 в рецепторно свързващия домейн (RBD), който е част от свързването на Spike към ACE2 рецептора.

2. Omicron очевидно епо-преносимот Delta & co и всъщност ги заменя по целия свят. Това увеличено предаване изглежда е свързано с висок афинитет към ACE2 рецептора и способността да се заобикалят имунните отговори на антителата (и може би по-добра способност за оцеляване в аерозоли).

3. Omicron е очевиднопо-малко патогененот Delta при експериментални животни (няколко независими проучвания потвърдиха тази констатация) и изглежда, че причинява по-леко заболяване при хората, намалявайки риска от хоспитализация, засега оценен между 67 -80%.

4. По-ниската патогенност на Omicron изглежда е свързана с по-ниската способност за инфектиране на клетките и образуване на синцитии в дълбоките белодробни тъкани, което съответства на по-нисък риск от развитие на тежка пневмония (всички в лицето на повишената способност за инфектиране на клетките на дихателните пътища по-горе)

5. По-ниската способност на Omicron да инфектира белите дробове изглежда е свързана с неспособността на ензима TMPRSS2 да разцепи шипа между S1 и S2 субединиците, което затруднява навлизането на вируса в клетките чрез „сливане на клетъчната повърхност“(докато навлизането е оптимизирано чрез „ендозомално сливане““, което се среща в клетките на горните дихателни пътища).

6. По-ниската способност на TMPRSS2 да разцепва шипа на Omicron изглежда се дължи на три мутации в областта на известното многоосновно място за разцепване на фурин (PRRAR), известно като H655Y, N679K и P681H (имайте предвид, че последното е различно от типичното за Delta P681R мутация).

7. Понастоящем не е ясно дали и до каква степен мутациите, които улесняват навлизането чрез ендозомално сливане на SARS-CoV-2 в клетките на горните дихателни пътища, са „структурно“свързани с тези, които ограничават способността на TMPRSS-2 да разцепва S1 / S2 (и по този начин да инфектира дълбоките бели дробове). Според мен този въпрос трябва да бъде проучен възможно най-скоро.

8. Omicron съдържа интересна и слабо характеризирана мутация (наречена I142V) в nsp-14, неструктурен протеин 14, чийто N-терминален домейн кодира екзонуклеаза, участваща в разчитането на корекцията на РНК-зависима РНК полимераза. С други думи, това е мутация в протеин, която може да повлияе на мутагенния капацитет на вируса.

Какво може да се случи: сценариите

1. Най-добрият сценарий е, че Omicron се разпространява, като остава като такъв или може би допълнително усъвършенства способността си да причинява инфекция на горните дихателни пътища (така нареченото „ охлаждане “, което някои вече спекулираха). В този случай вълната може да бъде много висока по отношение на броя на инфекциите, но и доста бърза във времето (вижте Gauteng) и с по-ниска смъртност от предишните вълни.

2. Междинният сценарий е, че Omicron, въпреки намалената смъртност, в крайна сметка причинява значителна абсолютна смъртност при неваксинирани или по друг начин неимунизирани субекти, особено ако са в напреднала възраст или са засегнати от съпътстващи заболявания, просто като следствие от големия брой инфекции (т.нар. " знаменател", за който знаем, че не е безкраен).

3. Най-лошият сценарий е, че Omicron ще „отстъпи“от трите мутации, които го правят безполезен от TMPRSS-2 и след това ще се върне към ефективността си при заразяване на белите дробове, без да губи повишената си преносимост.

Вероятността за този сценарий е доста ниска, също и защото не мога да си представя причина, поради която този вариант трябва да придобие ясно еволюционно предимство пред предишния. Тази възможност обаче в никакъв случай не е невъзможна и заслужава подходяща подготовка на ваксината.

Какво можем да направим

1. Избягвайте изкушението да мислите за контролиране на този вирус с методи, базирани на налагане на принудително разделяне между хората до горчивия край. Методите вече се оказаха почти безполезни и със сигурност неустойчиви срещу предишните варианти, но и срещу самия Omicron (вижте Австралия и Холандия за два скорошни примера).

2. Силно настояване зауниверсална ваксинация, включително трети дози (предоставящи неутрализираща защита срещу Omicron далеч над две дози), и особено включително ваксиниране на деца, включително тези под 5-годишна възраст, не толкова скоро колкото е възможно.Важно е да се разбере, че по този начин непълнолетните ще бъдат силно и вероятно постоянно защитени от случай номер 3, описан по-горе.

3. Опитайте се да приложите възможно най-скороантивирусни(по-специално paxlovid и моноклоналното антитяло Sotrovimab), които са ефективни срещу Omicron, като ги използвате по широко разпространен начин при всички заразени „рискови“субекти, като например хора на възраст над 65 години и с тежки заболявания, предразполагащи към Covid.

4. Не забравяйте да увеличите максималновъзприемчивосттаназдравната служба, като помните, че Covid ще е ендемичен по един или друг начин, като същевременно поддържа вероятни сезонни пикове на заболеваемост (да, сезонно е, нека си признаем), за което трябва да сме добре подготвени.

5. Опитайте се да направите комуникация с факти, научно базирана, без конфликти на интереси от всякакъв вид и най-вече нито катастрофална, нито минимизираща, а фокусирана върху обяснението на случващото се с яснота и простота, ръководена както винаги отоптимизъмкойто идва от знанието.

Популярна тема